鐘南山院士等醫(yī)學(xué)專家已證實(shí)新型冠狀病毒感染的肺炎存在人傳人現(xiàn)象，且病毒存在變異的可能，疫情存在著進(jìn)一步擴(kuò)散的風(fēng)險(xiǎn)。為防控疫情，病毒突變預(yù)測和抗新型冠狀病毒藥物研究迫在眉睫。

超級計(jì)算作為“國之重器”，在藥物篩選和病毒突變預(yù)測上可發(fā)揮重要作用。此前，深圳超算依托曙光6000強(qiáng)大的計(jì)算能力部署了藥物開發(fā)平臺(tái)，依托這個(gè)輔助藥物設(shè)計(jì)的科技創(chuàng)新平臺(tái)，科研人員可以完成靶點(diǎn)探尋，新藥篩選，先導(dǎo)物及試驗(yàn)優(yōu)化，藥理毒理等研究工作。

1月24日除夕夜，疫情告急，中山大學(xué)藥學(xué)院羅海彬教授提出緊急需求，需要大量計(jì)算資源，做抵抗新型冠狀病毒的藥物篩選和病毒突變預(yù)測。

深圳超算接到任務(wù)后迅速協(xié)調(diào)，優(yōu)先調(diào)度出兩個(gè)分區(qū)400多個(gè)節(jié)點(diǎn)的計(jì)算資源，并同步與合作伙伴協(xié)商，調(diào)度了曙光昆山的DCU資源和商湯公司的GPU資源，群策群力迅速組建應(yīng)急工作組，天津超算和騰訊公司也表示可以立即調(diào)度資源隨時(shí)待命。

在除夕夜里短短一小時(shí)內(nèi)，深圳超算已協(xié)調(diào)、對接好所有計(jì)算資源，為中山大學(xué)羅教授團(tuán)隊(duì)開通了高性能計(jì)算賬號(hào)，免費(fèi)提供所有計(jì)算資源。與時(shí)間賽跑，為生命護(hù)航，藥物篩選作業(yè)即刻進(jìn)行。

此外，根據(jù)最新消息，中國疾控中心病毒所所長許文波表示，目前該中心開始啟動(dòng)新型冠狀病毒的疫苗研發(fā)，目前已經(jīng)成功分離病毒，正在篩選種子毒株。另外，中國疾控中心正在進(jìn)行新型冠狀病毒肺炎的藥物篩選。

1月25日農(nóng)歷大年初一，在哈佛大學(xué)任教15年的流行病學(xué)家埃里克·費(fèi)格丁博士（Dr. Eric Feigl-Ding）在推特發(fā)表了對武漢肺炎的看法，引發(fā)了不小的轟動(dòng)。

他寫到：“我的圣母啊，新冠狀病毒（武漢肺炎）的R0值竟然是3.8！！！在我的職業(yè)生涯中，從未實(shí)際見過那么猛的系數(shù)。我并不是在夸大 ...”

注：一個(gè)感染者在傳染期內(nèi)在易感人群中引起的新感染者的期望人數(shù)，為傳染病的傳播速率，有人稱之為基本增生速率(Basic reproduction rate, R0)。

武漢肺炎R(shí)0值3.8這一數(shù)字出自英國蘭開斯特蘭開斯特大學(xué)、美國佛羅里達(dá)大學(xué)和英國格拉斯哥大學(xué)病毒研究中心的一項(xiàng)最新研究：

這項(xiàng)研究的主要發(fā)現(xiàn)包括：

1、我們估計(jì)感染的基本傳染數(shù)（????????0）明顯大于1。我們估計(jì)它在3.6到4.0之間，這表明72-75%的傳播必須通過控制感染措施來阻止增長。

2、我們估計(jì)，武漢市只有5.1%（95%可信區(qū)間，4.8-5.5）的感染被確定，這表明社區(qū)中存在大量感染，也反映了發(fā)現(xiàn)這種新疾病病例的困難。中國的公共衛(wèi)生部門對這種新型病原體進(jìn)行了非常迅速的監(jiān)測，從而能夠快速評估武漢和其他地區(qū)病例增長的速度。

3、如果控制或傳播沒有發(fā)生變化，那么我們預(yù)計(jì)在中國其他城市還會(huì)發(fā)生進(jìn)一步的疫情，而且感染將繼續(xù)以越來越快的速度傳播到國際目的地。

4、我們的模型表明，往返武漢市的旅行限制不太可能有效地阻止中國各地的傳播；隨著旅行有效減少99%，2月4日，武漢以外地區(qū)的疫情規(guī)模可能只會(huì)減少24.9%。

針對這項(xiàng)研究，埃里克·費(fèi)格丁博士發(fā)表了一系列評論：

“2019-nCoV病毒爆發(fā)的基本繁殖數(shù)比其他的急性冠狀病毒都要高，對其病原體的防控難度也會(huì)隨之大大提高！！！”

“它是不能單靠封閉隔離來阻斷的。武漢99%的封城隔離，甚至都不能在接下來兩周減少瘟疫傳播的三分之一。”

“我們可能正面臨自1918年西班牙流感之后，又一場失控的疫情。我們希望它不會(huì)重蹈1918年的覆轍，可是現(xiàn)代世界有著更快的傳播渠道。”

針對武漢肺炎和03年非典的對比，埃里克·費(fèi)格丁博士表示：“雖然有報(bào)道稱非典型肺炎開始遏制后的R0為0.49，但世衛(wèi)組織援引專家的話說，非典型肺炎最初的R0為2.9，然后是2.0-3.5，隔離后降至0.4。但非典比武漢病毒的癥狀更明顯。”

注：此前網(wǎng)上流傳的“武漢肺炎毒高SARS八倍”的說法是按照非典隔離后的R0 0.49計(jì)算的。

埃里克·費(fèi)格丁博士最新的一條置頂推文寫到：“另一個(gè)研究小組估計(jì)冠狀病毒的傳播為2.6（低于3.8份初步報(bào)告）。但是2.6仍然非常糟糕——每個(gè)感染者都會(huì)感染2.6個(gè)其他人。甚至作者也承認(rèn)，控制冠狀病毒爆發(fā)將非常困難。”

有部分網(wǎng)友認(rèn)為埃里克·費(fèi)格丁博士在危言聳聽，我們也希望不會(huì)出現(xiàn)研究中提到的那些情況。

其實(shí)，早在2018年，微軟聯(lián)合創(chuàng)始人比爾·蓋茨就在2018年由馬薩諸塞州醫(yī)學(xué)會(huì)主辦的活動(dòng)中表示：他是一個(gè)樂觀主義者，但世界上有一個(gè)領(lǐng)域并沒有“取得很大進(jìn)展”。這就是為大流行病作準(zhǔn)備。

全球流行病模擬

在活動(dòng)上，比爾·蓋茨展示了疾病建模研究所（Institute for Disease Modeling）進(jìn)行的模擬。

寫在最后：疫情告急，舉國之力都在行動(dòng)，科學(xué)家們正在抓緊研制特效藥，中國科學(xué)院兩上海團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)30種可能應(yīng)對新型肺炎藥品，中國超算也在做抵抗新型冠狀病毒的藥物篩選和病毒突變預(yù)測上貢獻(xiàn)力量，中國疾控中心正在研發(fā)新型冠狀病毒疫苗，所以大家不要恐慌，相信我們眾志成城一定能夠戰(zhàn)勝這次疫情。

文章來源：twitter等

IEEE Spectrum

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