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?? cjacobi.c

?? 《并行算法實踐》附帶的mpi源程序
?? C
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#include "stdio.h"#include "stdlib.h"#include "mpi.h"#include "math.h"#include "string.h"#define E 0.00001#define min -1#define intsize sizeof(int)#define charsize sizeof(char)#define floatsize sizeof(float)#define A(x,y) A[x*N+y]#define I(x,y) I[x*N+y]#define a(x,y) a[x*N+y]#define e(x,y) e[x*N+y]#define b(x) b[x]#define buffer(x,y) buffer[x*N+y]#define buffee(x,y) buffee[x*N+y]int M,N;int *b;int m,p;int myid,group_size;float *A,*I;float *a,*e;float max;float sum;double starttime,time1,time2,time3,endtime;MPI_Status status;float sgn(float v){    float f;    if (v>=0) f=1;    else f=-1;    return f;}void read_fileA(){    int i,j;    FILE *fdA;    time1=MPI_Wtime();    fdA=fopen("dataIn.txt","r");    fscanf(fdA,"%d %d", &M, &N);    if(M != N)    {        puts("The input is error!");        exit(0);    }    m=N/p; if (N%p!=0) m++;    A=(float*)malloc(floatsize*N*m*p);    I=(float*)malloc(floatsize*N*m*p);    for(i = 0; i < M; i ++)    {        for(j = 0; j < M; j ++) fscanf(fdA, "%f", A+i*M+j);    }    fclose(fdA);    printf("Input of file \"dataIn.txt\"\n");    printf("%d\t %d\n",M, N);    for(i=0;i<M;i++)    {        for(j=0;j<N;j++) printf("%f\t",A(i,j));        printf("\n");    }    for(i=0;i<N;i++)    {        for(j=0;j<N;j++)        {            if (i==j) I(i,j)=1;            else I(i,j)=0;        }    }}void send_a(){    int i;    for(i=1;i<p;i++)    {        MPI_Send(&(A(m*i,0)),m*N,MPI_FLOAT,i,i,MPI_COMM_WORLD);        MPI_Send(&(I(m*i,0)),m*N,MPI_FLOAT,i,i,MPI_COMM_WORLD);    }    free(A);    free(I);}void get_a(){    int i,j;    if (myid==0)    {        for(i=0;i<m;i++)            for(j=0;j<N;j++)        {            a(i,j)=A(i,j);            e(i,j)=I(i,j);        }    }    else    {        MPI_Recv(a,m*N,MPI_FLOAT,0,myid,MPI_COMM_WORLD,&status);        MPI_Recv(e,m*N,MPI_FLOAT,0,myid,MPI_COMM_WORLD,&status);    }}int main(int argc,char **argv){    float *c;    int k;    int loop;    int i,j,v,z,r,t,y;    int i1,j1;    float f,g,h;    float sin1,sin2,cos1;    float s1,c1;    float *br,*bt,*bi,*bj,*zi,*zj;    float *temp1,*temp2,*buffer,*buffee;    int counter,current;    int *buf;    int mml,mpl;    float bpp,bqq,bpq,bqp;    float lmax;    MPI_Init(&argc,&argv);    MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD,&group_size);    MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD,&myid);    if (myid==0) starttime=MPI_Wtime();    p=group_size;    max=10.0;    loop=0;    if (myid==0) read_fileA();    MPI_Bcast(&N,1,MPI_INT,0,MPI_COMM_WORLD);    m=N/p;    if (N%p!=0) m++;    a=(float*)malloc(floatsize*m*N);    e=(float*)malloc(floatsize*m*N);    b=(int*)malloc(intsize*m);    br=(float*)malloc(floatsize*N);    bt=(float*)malloc(floatsize*N);    bi=(float*)malloc(floatsize*m);    bj=(float*)malloc(floatsize*m);    zi=(float*)malloc(floatsize*m);    zj=(float*)malloc(floatsize*m);    temp1=(float*)malloc(floatsize*4);    temp2=(float*)malloc(floatsize*4*p);    if ((myid==p-1)&&(myid%2!=0))    {        buffer=(float*)malloc(floatsize*m/2*N);        buffee=(float*)malloc(floatsize*m/2*N);        buf=(int*)malloc(intsize*m/2);            /* store i,j */    }    if ((myid%2!=0)&&(myid!=p-1))    {        buffer=(float*)malloc(floatsize*m*N);        buffee=(float*)malloc(floatsize*m*N);        buf=(int*)malloc(intsize*m);    }    if (myid==0)    {        get_a();        send_a();    }    else    {        get_a();    }    if (myid==0)                                  /* start computing now */        time2=MPI_Wtime();    for(i=0;i<m;i++)        b(i)=myid*m+i;    while (fabs(max)>E)    {        loop++;        for(i=myid*m;i<(myid+1)*m-1;i++)            for(j=i+1;j<=(myid+1)*m-1;j++)        {            r=i%m; t=j%m;                         /* to make a(r,j) zero use a(r,i) a(t,j) */            if(a(r,j)!=0)            {                f=(-a(r,j));                g=(a(t,j)-a(r,i))/2;                h=sgn(g)*f/sqrt(f*f+g*g);                sin2=h;                sin1=h/sqrt(2*(1+sqrt(1-h*h)));                cos1=sqrt(1-sin1*sin1);                bpp=a(r,i)*cos1*cos1+a(t,j)*sin1*sin1+a(r,j)*sin2;                bqq=a(r,i)*sin1*sin1+a(t,j)*cos1*cos1-a(r,j)*sin2;                bpq=0; bqp=0;                for(v=0;v<N;v++)                  /* compute row */                    if ((v!=i)&&(v!=j))                {                    br[v]=a(r,v)*cos1+a(t,v)*sin1;                    a(t,v)=(-a(r,v))*sin1+a(t,v)*cos1;                }                for(v=0;v<N;v++)                  /* row */                    if ((v!=i)&&(v!=j))                {                    a(r,v)=br[v];                }                for(v=0;v<m;v++)                    br[v]=e(v,i)*cos1+e(v,j)*sin1;                for(v=0;v<m;v++)                    e(v,j)=e(v,i)*(-sin1)+e(v,j)*cos1;                for(v=0;v<m;v++)                    e(v,i)=br[v];                for(v=0;v<m;v++)                  /* compute col */                    if ((v!=r)&&(v!=t))                {                    bi[v]=a(v,i)*cos1+a(v,j)*sin1;                    a(v,j)=(-a(v,i))*sin1+a(v,j)*cos1;                }                for(v=0;v<m;v++)                  /* col */                    if ((v!=r)&&(v!=t))                        a(v,i)=bi[v];                a(r,i)=bpp;                a(t,j)=bqq;                a(r,j)=bpq;                a(t,i)=bqp;                temp1[0]=sin1;                temp1[1]=cos1;                temp1[2]=(float)i;                temp1[3]=(float)j;            }            else            {                temp1[0]=0.0;                temp1[1]=0.0;                temp1[2]=0.0;                temp1[3]=0.0;            }                                     /* end of if */            MPI_Allgather(temp1,4,MPI_FLOAT,temp2,4,MPI_FLOAT,MPI_COMM_WORLD);            current=0;            for(v=1;v<=p;v++)            {                s1=temp2[(v-1)*4+0];                c1=temp2[(v-1)*4+1];                i1=(int)temp2[(v-1)*4+2];                j1=(int)temp2[(v-1)*4+3];                if ((s1!=0.0)||(c1!=0.0)||(i1!=0)||(j1!=0))                {                    if (myid!=current)                    {                        for(z=0;z<m;z++)                        {                            zi[z]=a(z,i1)*c1 + a(z,j1)*s1;                            a(z,j1)=-a(z,i1)*s1 + a(z,j1)*c1;                        }                        for(z=0;z<m;z++)                            a(z,i1)=zi[z];                        for(z=0;z<m;z++)                            zi[z]=e(z,i1)*c1+e(z,j1)*s1;                        for(z=0;z<m;z++)                            e(z,j1)=-e(z,i1)*s1+e(z,j1)*c1;                        for(z=0;z<m;z++)                            e(z,i1)=zi[z];                    }                             /* if myid!=current */                }                                 /* if */                current=current+1;            }                                     /* for v */        }                                         /* for i,j */        for(counter=1;counter<=2*p-2;counter++)        {            if (myid==0)            {                MPI_Send(&(a(m/2,0)),m/2*N,MPI_FLOAT,myid+1,myid+1,MPI_COMM_WORLD);                MPI_Send(&(e(m/2,0)),m/2*N,MPI_FLOAT,myid+1,myid+1,MPI_COMM_WORLD);                MPI_Send(&b(m/2),m/2,MPI_INT,myid+1,myid+1,MPI_COMM_WORLD);                MPI_Recv(&(a(m/2,0)),m/2*N,MPI_FLOAT,myid+1,myid,MPI_COMM_WORLD,&status);                MPI_Recv(&(e(m/2,0)),m/2*N,MPI_FLOAT,myid+1,myid,MPI_COMM_WORLD,&status);                MPI_Recv(&b(m/2),m/2,MPI_INT,myid+1,myid,MPI_COMM_WORLD,&status);            }            if ((myid==p-1)&&(myid%2!=0))            {                for(i=m/2;i<m;i++)                    for(j=0;j<N;j++)                        buffer((i-m/2),j)=a(i,j);                for(i=m/2;i<m;i++)                    for(j=0;j<N;j++)                        buffee((i-m/2),j)=e(i,j);                for(i=m/2;i<m;i++)                    buf[i-m/2]=b(i);                for(i=0;i<m/2;i++)                    for(j=0;j<N;j++)                        a((i+m/2),j)=a(i,j);                for(i=0;i<m/2;i++)                    for(j=0;j<N;j++)                        e((i+m/2),j)=e(i,j);                for(i=0;i<m/2;i++)                    b(m/2+i)=b(i);                MPI_Recv(&(a(0,0)),m/2*N,MPI_FLOAT,myid-1,myid,MPI_COMM_WORLD,&status);                MPI_Recv(&(e(0,0)),m/2*N,MPI_FLOAT,myid-1,myid,MPI_COMM_WORLD,&status);                MPI_Recv(&b(0),m/2,MPI_INT,myid-1,myid,MPI_COMM_WORLD,&status);                MPI_Send(buffer,m/2*N,MPI_FLOAT,myid-1,myid-1,MPI_COMM_WORLD);                MPI_Send(buffee,m/2*N,MPI_FLOAT,myid-1,myid-1,MPI_COMM_WORLD);                MPI_Send(buf,m/2,MPI_INT,myid-1,myid-1,MPI_COMM_WORLD);            }            if ((myid==p-1)&&(myid%2==0))            {                MPI_Send(&(a(m/2,0)),m/2*N,MPI_FLOAT,myid-1,myid-1,MPI_COMM_WORLD);                MPI_Send(&(e(m/2,0)),m/2*N,MPI_FLOAT,myid-1,myid-1,MPI_COMM_WORLD);                MPI_Send(&b(m/2),m/2,MPI_INT,myid-1,myid-1,MPI_COMM_WORLD);                for(i=0;i<m/2;i++)                    for(j=0;j<N;j++)                        a((i+m/2),j)=a(i,j);                for(i=0;i<m/2;i++)                    for(j=0;j<N;j++)

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