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?? test_farthest_sampling_3d.m.svn-base

?? fast marching method
?? SVN-BASE
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% test for farthest point sampling for volumetric meshn = 150;name = 'constant';name = 'central';name = 'sphere';name = 'medical';rep = ['results/farthest-sampling-3d/' name '/'];if exist(rep)~=7    mkdir(rep);endswitch name    case 'constant'        W = ones(n,n,n);    case {'central' 'sphere'}        x = linspace(-1,1,n);        [X,Y,Z] = meshgrid(x, x, x);        W = sqrt( X.^2+Y.^2+Z.^2 );        if strcmp(name, 'sphere')            r = .6;            W = rescale( -(W<=r) );        end        W = rescale(W,.1,1);    case 'medical'                load brain1-crop-256.mat        M = crop(M,n);        W = rescale(-abs(M-median(M(:))));        W = rescale( clamp(W,.6,1),.2,1);    otherwise        error('Unknown potential');endmethod = 'geodesic';method = 'delaunay';% padd to treat correctly boundaryif strcmp(method, 'geodesic')    k = 10;    W1 = perform_image_extension(W,n+2*k, '2side');end% plot sampling locationms = 20; lw = 3;i = 0;for npoints = [400 800 1600 3000 5000 10000]    i = i+1;    disp('Perform farthest point sampling');    if i==1        [x,y,z] = meshgrid([1 n], [1 n], [1 n]);        vertex = cat(1, x(:)', y(:)', z(:)');    end    vertex = perform_farthest_point_sampling( W, vertex, npoints-size(vertex,2) );        % display sampling    clf;    hold on;    h = imageplot(W);     view(60,30); zoom(.8);  camlight;    alphamap(linspace(0,.1,100)); vol3d(h);    h = plot3(vertex(1,:),vertex(2,:),vertex(3,:), '.');    set(h, 'MarkerSize', ms);    hold off;    saveas(gcf, [rep name '-sampling-' num2string_fixeddigit(npoints,5) '.png'], 'png');        % compute the associated triangulation    if strcmp(method, 'delaunay')        faces = delaunay3(vertex(1,:),vertex(2,:),vertex(3,:))';    else        vertex1 = vertex+k;        [D,Z,Q] = perform_fast_marching(W1, vertex1);        faces = compute_voronoi_triangulation(Q,vertex);    end        w = [1 1 1]; w = w(:)/sqrt(sum(w.^2));    t = sum(vertex.*repmat(w,[1 size(vertex,2)]));    delta = max(t)-min(t);    offlist = linspace( min(t(:)) + .3*delta, max(t(:)) - .3*delta, 5 );    for i=1:length(offlist)                options.cutting_plane = w;        options.cutting_offs = offlist(i);        clf;        hold on;        %h = imageplot(W);        %alphamap(linspace(0,.1,100));         plot_mesh(vertex,faces, options);        % set(h{2}, 'Marker', 'r.');        view(60,30); zoom(.8);  camlight;                % vol3d(h);        hold off;        saveas(gcf, [rep name '-sampling-' num2string_fixeddigit(npoints,5) '-mesh-' num2str(i) '.png'], 'png');    end    end

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