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這里提供的matlab函數(shù)有四個(gè),分別是移動(dòng)窗口最小二乘多項(xiàng)式平滑(sgsmooth.m),移動(dòng)窗口中位數(shù)平滑(median_smooth.m),粗糙懲罰平滑(rpsmooth.m)以及kernel平滑(kernel.m)。
移動(dòng)窗口最小二乘多項(xiàng)式平滑采用的格式是:
y=sgsmooth(x,width,order)
x是數(shù)據(jù):光譜或者是色譜,而且輸入形式必須為一個(gè)向量,width是平滑時(shí)選擇的窗口寬度,order是多項(xiàng)式擬和的次數(shù)。需要注意的是多項(xiàng)式擬和的次數(shù)order必須小于width,而且width必須為一個(gè)奇數(shù),否則提示error。
移動(dòng)窗口中位數(shù)平滑的格式:
y=median_smooth(x,width)
x是光譜或者色譜數(shù)據(jù),同樣輸入必須為一個(gè)向量,width是移動(dòng)平滑窗口寬度。
粗糙懲罰平滑格式:
f=rpsmooth(x,nambda),x為光譜或者色譜數(shù)據(jù),也必須為一個(gè)向量。nambda為懲罰參數(shù),可以為一個(gè)數(shù),也可以為一個(gè)含有兩個(gè)數(shù)的向量,nambda向量中的元素但是不能超過2,因?yàn)槿绻麑Υ植趹土P有所認(rèn)識,可以直接輸入一個(gè)數(shù)進(jìn)行計(jì)算,而如果對參數(shù)選擇沒有把握,則可以以[up low]的向量形式輸入兩個(gè)值進(jìn)行計(jì)算。nambda不能為0。如果nambda為0,無平滑效果。如果沒有選擇nambda值,默認(rèn)的是從1:100進(jìn)行循環(huán)計(jì)算,步長為10。
需要注意的是,在matlab中產(chǎn)生一個(gè)矩陣Q和R(詳見算法文檔或者分析化學(xué)手冊第十分冊)時(shí)間花費(fèi)比較大,如果數(shù)據(jù)點(diǎn)大于1000,建議分段計(jì)算,我計(jì)算了一下,用1000個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)進(jìn)行計(jì)算,時(shí)間花費(fèi)是70~80s。
kernel平滑格式:
smooth_d=kernel(t,x,h,fun)
x同樣是一個(gè)光譜或者色譜數(shù)據(jù)向量。t為光譜中的波長點(diǎn)或者色譜中的保留時(shí)間點(diǎn),如果沒有這些數(shù)據(jù)的,可以用點(diǎn)數(shù)來代替,比如x數(shù)據(jù)點(diǎn)有500個(gè),可用其索引1,2,3,…等來組成一個(gè)向量t。h為帶寬,必須為正數(shù)。fun為kern函數(shù),在matlab文件中提供了四個(gè)函數(shù):均勻函數(shù),二次函數(shù),一階導(dǎo)數(shù)估計(jì)和二階導(dǎo)數(shù)估計(jì),詳細(xì)請見算法文檔,但是一階導(dǎo)數(shù)和二階導(dǎo)數(shù)估計(jì)在平滑中沒有用到,因此沒有給予介紹。分別用'uni','qua','fde','sde'表示。默認(rèn)的是采用二次函數(shù)平滑。
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