一個自制的生物信息學程序。
這個程序目的是在基因組文件bsubt168_whole.nuc(部分)中查找設置文件ss.ini所記錄的短核苷酸序列CTTAAG(這種短核苷酸一般稱寡核苷酸)及其互補序列在該基因組的每10000個堿基中出現的次數。
程序先將碰到的寡核苷酸及其互補序列的位置保存在臨時文件ss.tmp中,然后利用這個文件統計每10000個堿基中它們的出現次數并記錄在ss.csv中(可用excel打開)。如果某10000個堿基中的出現次數為0,則不被記錄。
標簽:
CTTAAG
bsubt
whole
168
上傳時間:
2014-01-26
上傳用戶:小儒尼尼奧