一個(gè)自制的生物信息學(xué)程序。
這個(gè)程序目的是在基因組文件bsubt168_whole.nuc(部分)中查找設(shè)置文件ss.ini所記錄的短核苷酸序列CTTAAG(這種短核苷酸一般稱寡核苷酸)及其互補(bǔ)序列在該基因組的每10000個(gè)堿基中出現(xiàn)的次數(shù)。
程序先將碰到的寡核苷酸及其互補(bǔ)序列的位置保存在臨時(shí)文件ss.tmp中,然后利用這個(gè)文件統(tǒng)計(jì)每10000個(gè)堿基中它們的出現(xiàn)次數(shù)并記錄在ss.csv中(可用excel打開)。如果某10000個(gè)堿基中的出現(xiàn)次數(shù)為0,則不被記錄。
標(biāo)簽:
CTTAAG
bsubt
whole
168
上傳時(shí)間:
2014-01-26
上傳用戶:小儒尼尼奧