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生物信息

  • 生物信息學算法導論(腦控技術叢書)

    生物信息學算法導論(腦控技術叢書)腦控,信息,算法

    標簽: 腦控技術 生物信息

    上傳時間: 2022-06-08

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  • 基于ARM的嵌入式無線遠程環境監測系統.rar

    在數字化推進速度加快的大背景下,全球農業也由傳統農業向現代農業方向轉變,而實現農業信息與數字化則是現代化農業的重要標志與核心技術。我國農業具有地域分散、對象多樣、生物自身變異大、環境因子不確定等特點,也是受環境影響最明顯的領域,因此對環境與生物信息的監測顯得十分重要。同時現代無線網絡信息技術和計算機應用等技術近幾年得到了長足的發展,廣泛的應用于工業的各個領域。因此,將這些最新的技術應用于相對發展較慢的農業各領域顯得迫在眉睫。 本文根據農業對象具有偏遠、分散、易變、多樣等特點,提出了一種針對農業環境信息遠程監測的系統設計方案,并從軟件和硬件二方面詳細介紹了系統方案的設計和實現方法。本研究通過采用μC/OS-Ⅱ系統的嵌入式技術,實現了數據采集系統底層網絡與信息發布上層網絡的無縫連接為建立基于WEB的農業環境遠程監測系統奠定了基礎,同時也為農業網絡通信“最后一公里”問題的解決提供了一種解決方案。 該系統的設計充分利用了網絡技術。通過INTERNET,用戶可以隨時了解農業環境的實時情況以采取措施。系統中嵌入式操作系統μC/OS-Ⅱ的應用提高了系統的實時性、可靠性和可擴展性:減少了對系統硬件的依賴,增加了系統安全性;降低了成本。特別是自主開發的核心板卡,經連續的調試運行穩定、數據可靠。 本文首先介紹了高速實時數據采集系統的發展和現狀。由于傳統的設計方式的欠缺而考慮到將嵌入式操作系統引入到該系統中,很好的解決了多傳感器的接入,使得本系統具有巨大的靈活性和可擴展性。 本文以源碼開放的嵌入式操作系統μC/OS-Ⅱ為核心,以LPC2210微控制器為載體,充分利用GPRS無線網絡傳輸技術,實現了高速實時信息監測系統的關鍵設計。 考慮到該系統以后的可擴展性,在設計的過程中硬件部分預留了一部分接口電路以備后續開發使用;軟件的設計過程中應該注意的問題和實際操作中出現的一系列問題以及解決辦法在文中都有詳細的說明,并且軟件的基本構架在文章中也有所體現,文章結尾給出了一些系統經實驗后在WEB上發布顯示的數據。

    標簽: ARM 嵌入式 無線遠程

    上傳時間: 2013-07-09

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  • 基于ARM的設施農業網絡型可編程自動控制系統

    我國是世界上設施農業面積最大的國家,設施面積占世界總面積的70-80%。目前國內設施溫室應用的主要環境參數采控系統大多為進口產品,這些產品技術含量高,采控效果好,但相對價格較高,通常適用于現代化的大型或高檔連棟溫室。少數國產品牌無論技術水平還是采控效果均不甚理想,尤其缺少能夠適用于我國常見的中小型日光溫室的低成本智能采集控制裝置。本文基于國家高技術研究發展計劃(863計劃)課題“設施農業精準生產技術系統構建與應用”,對設施溫室環境和生物信息數據采集、傳輸、備份、調控問題進行了研究。 論文分析了目前國內中小型日光溫室環境監控需求,提出并實現了一套網絡型設施農業日光溫室智能控制系統從硬件到軟件的完整方案。主要研究工作如下: (1) 開發了面向常用環境信息傳感器和生物信息傳感器的數據采集模塊,該數據采集模塊具有可定制、可擴展的特點。 (2) 開發了基于CF卡的數據備份及存儲模塊,為實現現場數據的大容量存儲和本地化自主控制提供了基礎。 (3) 構建了傳感器數據的局域傳輸網絡和以太網絡接口,滿足了節點環境參數及視頻信息寬帶傳輸與溫室集中監控的需要。 (4) 開發了面向中小型日光溫室的可擴展核心設備管理模塊,實現了在決策服務器支持下的環境參數本地自主調控。 (5) 移植了嵌入式操作系統、開發了設備驅動程序,使用戶可以靈活方便地調用板載設備進行系統的二次定制開發。 (6) 對系統軟件、硬件進行了模擬調試和現場實驗,驗證了系統在設施溫室環境采控中的各項功能。 論文結構如下:首先分析了課題的研究背景、意義、研究現狀和相應關鍵技術;然后在溫室控制的需求分析上提出了智能控制系統的方案;接著給出了智能PAC系統子/主節點的硬件設計及實現,給出了基于U-BOOT與uClinux的智能PAC系統軟件設計和驅動開發;其次設計了實驗平臺對智能PAC系統進行仿真調試和現場實驗。論文最后展望了我國設施農業溫室環境監控的發展。 現場實驗表明,該智能PAC系統解決了日光溫室環境和生物信息數據采集、傳輸、備份問題,并且具有可定制化、可編程、運行穩定可靠的特點,達到了預期的設計要求。

    標簽: ARM 設施農業 網絡 可編程

    上傳時間: 2013-04-24

    上傳用戶:qw12

  • 基于ARM的嵌入式無線遠程環境監測系統

    在數字化推進速度加快的大背景下,全球農業也由傳統農業向現代農業方向轉變,而實現農業信息與數字化則是現代化農業的重要標志與核心技術。我國農業具有地域分散、對象多樣、生物自身變異大、環境因子不確定等特點,也是受環境影響最明顯的領域,因此對環境與生物信息的監測顯得十分重要。同時現代無線網絡信息技術和計算機應用等技術近幾年得到了長足的發展,廣泛的應用于工業的各個領域。因此,將這些最新的技術應用于相對發展較慢的農業各領域顯得迫在眉睫。 本文根據農業對象具有偏遠、分散、易變、多樣等特點,提出了一種針對農業環境信息遠程監測的系統設計方案,并從軟件和硬件二方面詳細介紹了系統方案的設計和實現方法。本研究通過采用μC/OS-Ⅱ系統的嵌入式技術,實現了數據采集系統底層網絡與信息發布上層網絡的無縫連接為建立基于WEB的農業環境遠程監測系統奠定了基礎,同時也為農業網絡通信“最后一公里”問題的解決提供了一種解決方案。 該系統的設計充分利用了網絡技術。通過INTERNET,用戶可以隨時了解農業環境的實時情況以采取措施。系統中嵌入式操作系統μC/OS-Ⅱ的應用提高了系統的實時性、可靠性和可擴展性:減少了對系統硬件的依賴,增加了系統安全性;降低了成本。特別是自主開發的核心板卡,經連續的調試運行穩定、數據可靠。 本文首先介紹了高速實時數據采集系統的發展和現狀。由于傳統的設計方式的欠缺而考慮到將嵌入式操作系統引入到該系統中,很好的解決了多傳感器的接入,使得本系統具有巨大的靈活性和可擴展性。 本文以源碼開放的嵌入式操作系統μC/OS-Ⅱ為核心,以LPC2210微控制器為載體,充分利用GPRS無線網絡傳輸技術,實現了高速實時信息監測系統的關鍵設計。 考慮到該系統以后的可擴展性,在設計的過程中硬件部分預留了一部分接口電路以備后續開發使用;軟件的設計過程中應該注意的問題和實際操作中出現的一系列問題以及解決辦法在文中都有詳細的說明,并且軟件的基本構架在文章中也有所體現,文章結尾給出了一些系統經實驗后在WEB上發布顯示的數據。

    標簽: ARM 嵌入式 無線遠程 環境監測系統

    上傳時間: 2013-05-17

    上傳用戶:hw1688888

  • 隨著人類基因組計劃的實施

    隨著人類基因組計劃的實施,通過基因組測序,蛋白質序列測定結構解析等實驗,分子生物學家提供了大量的有關生物分子的原始數據,需要利用現代計算技術對這些原始數據進行收集、整理、管理以便于檢索使用。而為了解釋和理解這些數據,還需要對數據進行比對、分析,建立計算模型,進行仿真、預測與驗證,因而出現生物信息學,它的出現,極大的促進了分子生物學的發展。

    標簽: 基因組

    上傳時間: 2015-03-11

    上傳用戶:894898248

  • 這是一些經典算法的描述

    這是一些經典算法的描述,是由中國科學院的張法院士所編寫的,對生物信息學有非常重要的意義。

    標簽: 算法

    上傳時間: 2014-12-02

    上傳用戶:athjac

  • 矩形編碼壓縮源代碼是針對圖象壓縮設計的程序

    矩形編碼壓縮源代碼是針對圖象壓縮設計的程序,該算法可用于生物信息學,圖象處理等方面

    標簽: 矩形 源代碼 圖象壓縮 編碼

    上傳時間: 2015-04-13

    上傳用戶:xz85592677

  • 這是我在別人的工作基礎上編寫的生命游戲(life game)演示程序

    這是我在別人的工作基礎上編寫的生命游戲(life game)演示程序,可以比較不同初始條件或繁衍條件產生的不同演化結果。 生命游戲是細胞自動機的一種,以模擬生命的某種繁衍過程。根據不同的生命繁衍條件,可以衍生出豐富多彩的群體動力學。該游戲曾經繁盛過一時,至今仍有很多愛好者。該模型在很多領域(如生物、物理等)都有實際的應用。 在這個生命游戲中,繁衍條件比較簡單。有兩個60x60的方框區域,開始時每一個格子里都生活著一個生命個體(用1表示)。然后這些個體按照下面的條件繁衍:首先計算每一個格子周圍相鄰生存者的個數;如果有3個相鄰生存者,下一步這個格子將會有生存者(用黑色表示);如果有2個(右邊方框的是1個),這個格子下一步的狀態與上一步狀態相同;其余的情況下,下一步這個格子將沒有生存者(白色)。每一步計算所有的格子,共重復300步(開始6步按任意鍵執行,以觀察開始的演化,后面的自動執行)。 該程序用Turbo C++ 3.0編譯。這個游戲在《生物信息學》課上作為離散數學模型的演示程序。

    標簽: life game 編寫 程序

    上傳時間: 2013-11-30

    上傳用戶:sammi

  • EM算法的改進

    EM算法的改進,在此基礎上生物信息學的常用工具

    標簽: 法的改進

    上傳時間: 2013-12-25

    上傳用戶:bcjtao

  • 《統計學習基礎 數據挖掘推理與預測》中文版.pdf

    統計學習基礎:數據挖掘、推理與預測介紹了這些領域的一些重要概念。盡管應用的是統計學方法,但強調的是概念,而不是數學。許多例子附以彩圖。《統計學習基礎:數據挖掘、推理與預測》內容廣泛,從有指導的學習(預測)到無指導的學習,應有盡有。包括神經網絡、支持向量機、分類樹和提升等主題,是同類書籍中介紹得最全面的。計算和信息技術的飛速發展帶來了醫學、生物學、財經和營銷等諸多領域的海量數據。理解這些數據是一種挑戰,這導致了統計學領域新工具的發展,并延伸到諸如數據挖掘、機器學習和生物信息學等新領域。許多工具都具有共同的基礎,但常常用不同的術語來表達。【內容推薦】《統計學習基礎:數據挖掘、推理與預測》試圖將學習領域中許多重要的新思想匯集在一起,并且在統計學的框架下解釋它們。隨著計算機和信息時代的到來,統計問題的規模和復雜性都有了急劇增加。數據存儲、組織和檢索領域的挑戰導致一個新領域“數據挖掘”的產生。數據挖掘是一個多學科交叉領域,涉及數據庫技術、機器學習、統計學、神經網絡、模式識別、知識庫、信息提取、高性能計算等諸多領域,并在工業、商務、財經、通信、醫療衛生、生物工程、科學等眾多行業得到了廣泛的應用。【作者簡介】Trevor Hastie,Robert Tibshirani和Jerome Friedman都是斯坦福大學統計學教授,并在這個領域做出了杰出的貢獻。Hastie和Tibshirani提出了廣義和加法模型,并出版專著“Generalized Additive Models”。Hastie的主要研究領域為:非參數回歸和分類、統計計算以及生物信息學、醫學和工業的特殊數據挖掘問題。他提出主曲線和主曲面的概念,并用S-PLUS編寫了大量統計建模軟件。Tibshirani的主要研究領域為:應用統計學、生物統計學和機器學習。他提出了套索的概念,還是“An Introduction to the Bootstrap”一書的作者之一。Friedman是CART、MARS和投影尋蹤等數據挖掘工具的發明人之一。他不僅是位統計學家,而且是物理學家和計算機科學家,先后在物理學、計算機科學和統計學的一流雜志上表發論文80余篇。

    標簽: 統計

    上傳時間: 2022-05-04

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