生物信息學算法導論(腦控技術(shù)叢書）腦控，信息，算法
上傳時間： 2022-06-08
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在數(shù)字化推進速度加快的大背景下，全球農(nóng)業(yè)也由傳統(tǒng)農(nóng)業(yè)向現(xiàn)代農(nóng)業(yè)方向轉(zhuǎn)變，而實現(xiàn)農(nóng)業(yè)信息與數(shù)字化則是現(xiàn)代化農(nóng)業(yè)的重要標志與核心技術(shù)。我國農(nóng)業(yè)具有地域分散、對象多樣、生物自身變異大、環(huán)境因子不確定等特點，也是受環(huán)境影響最明顯的領(lǐng)域，因此對環(huán)境與生物信息的監(jiān)測顯得十分重要。同時現(xiàn)代無線網(wǎng)絡(luò)信息技術(shù)和計算機應(yīng)用等技術(shù)近幾年得到了長足的發(fā)展，廣泛的應(yīng)用于工業(yè)的各個領(lǐng)域。因此，將這些最新的技術(shù)應(yīng)用于相對發(fā)展較慢的農(nóng)業(yè)各領(lǐng)域顯得迫在眉睫。 本文根據(jù)農(nóng)業(yè)對象具有偏遠、分散、易變、多樣等特點，提出了一種針對農(nóng)業(yè)環(huán)境信息遠程監(jiān)測的系統(tǒng)設(shè)計方案，并從軟件和硬件二方面詳細介紹了系統(tǒng)方案的設(shè)計和實現(xiàn)方法。本研究通過采用μC/OS-Ⅱ系統(tǒng)的嵌入式技術(shù)，實現(xiàn)了數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)底層網(wǎng)絡(luò)與信息發(fā)布上層網(wǎng)絡(luò)的無縫連接為建立基于WEB的農(nóng)業(yè)環(huán)境遠程監(jiān)測系統(tǒng)奠定了基礎(chǔ)，同時也為農(nóng)業(yè)網(wǎng)絡(luò)通信“最后一公里”問題的解決提供了一種解決方案。 該系統(tǒng)的設(shè)計充分利用了網(wǎng)絡(luò)技術(shù)。通過INTERNET，用戶可以隨時了解農(nóng)業(yè)環(huán)境的實時情況以采取措施。系統(tǒng)中嵌入式操作系統(tǒng)μC/OS-Ⅱ的應(yīng)用提高了系統(tǒng)的實時性、可靠性和可擴展性：減少了對系統(tǒng)硬件的依賴，增加了系統(tǒng)安全性；降低了成本。特別是自主開發(fā)的核心板卡，經(jīng)連續(xù)的調(diào)試運行穩(wěn)定、數(shù)據(jù)可靠。 本文首先介紹了高速實時數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)的發(fā)展和現(xiàn)狀。由于傳統(tǒng)的設(shè)計方式的欠缺而考慮到將嵌入式操作系統(tǒng)引入到該系統(tǒng)中，很好的解決了多傳感器的接入，使得本系統(tǒng)具有巨大的靈活性和可擴展性。 本文以源碼開放的嵌入式操作系統(tǒng)μC/OS-Ⅱ為核心，以LPC2210微控制器為載體，充分利用GPRS無線網(wǎng)絡(luò)傳輸技術(shù)，實現(xiàn)了高速實時信息監(jiān)測系統(tǒng)的關(guān)鍵設(shè)計。 考慮到該系統(tǒng)以后的可擴展性，在設(shè)計的過程中硬件部分預留了一部分接口電路以備后續(xù)開發(fā)使用；軟件的設(shè)計過程中應(yīng)該注意的問題和實際操作中出現(xiàn)的一系列問題以及解決辦法在文中都有詳細的說明，并且軟件的基本構(gòu)架在文章中也有所體現(xiàn)，文章結(jié)尾給出了一些系統(tǒng)經(jīng)實驗后在WEB上發(fā)布顯示的數(shù)據(jù)。
上傳時間： 2013-07-09
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我國是世界上設(shè)施農(nóng)業(yè)面積最大的國家，設(shè)施面積占世界總面積的70-80％。目前國內(nèi)設(shè)施溫室應(yīng)用的主要環(huán)境參數(shù)采控系統(tǒng)大多為進口產(chǎn)品，這些產(chǎn)品技術(shù)含量高，采控效果好，但相對價格較高，通常適用于現(xiàn)代化的大型或高檔連棟溫室。少數(shù)國產(chǎn)品牌無論技術(shù)水平還是采控效果均不甚理想，尤其缺少能夠適用于我國常見的中小型日光溫室的低成本智能采集控制裝置。本文基于國家高技術(shù)研究發(fā)展計劃(863計劃)課題“設(shè)施農(nóng)業(yè)精準生產(chǎn)技術(shù)系統(tǒng)構(gòu)建與應(yīng)用”，對設(shè)施溫室環(huán)境和生物信息數(shù)據(jù)采集、傳輸、備份、調(diào)控問題進行了研究。 論文分析了目前國內(nèi)中小型日光溫室環(huán)境監(jiān)控需求，提出并實現(xiàn)了一套網(wǎng)絡(luò)型設(shè)施農(nóng)業(yè)日光溫室智能控制系統(tǒng)從硬件到軟件的完整方案。主要研究工作如下： (1) 開發(fā)了面向常用環(huán)境信息傳感器和生物信息傳感器的數(shù)據(jù)采集模塊，該數(shù)據(jù)采集模塊具有可定制、可擴展的特點。 (2) 開發(fā)了基于CF卡的數(shù)據(jù)備份及存儲模塊，為實現(xiàn)現(xiàn)場數(shù)據(jù)的大容量存儲和本地化自主控制提供了基礎(chǔ)。 (3) 構(gòu)建了傳感器數(shù)據(jù)的局域傳輸網(wǎng)絡(luò)和以太網(wǎng)絡(luò)接口，滿足了節(jié)點環(huán)境參數(shù)及視頻信息寬帶傳輸與溫室集中監(jiān)控的需要。 (4) 開發(fā)了面向中小型日光溫室的可擴展核心設(shè)備管理模塊，實現(xiàn)了在決策服務(wù)器支持下的環(huán)境參數(shù)本地自主調(diào)控。 (5) 移植了嵌入式操作系統(tǒng)、開發(fā)了設(shè)備驅(qū)動程序，使用戶可以靈活方便地調(diào)用板載設(shè)備進行系統(tǒng)的二次定制開發(fā)。 (6) 對系統(tǒng)軟件、硬件進行了模擬調(diào)試和現(xiàn)場實驗，驗證了系統(tǒng)在設(shè)施溫室環(huán)境采控中的各項功能。 論文結(jié)構(gòu)如下：首先分析了課題的研究背景、意義、研究現(xiàn)狀和相應(yīng)關(guān)鍵技術(shù)；然后在溫室控制的需求分析上提出了智能控制系統(tǒng)的方案；接著給出了智能PAC系統(tǒng)子/主節(jié)點的硬件設(shè)計及實現(xiàn)，給出了基于U-BOOT與uClinux的智能PAC系統(tǒng)軟件設(shè)計和驅(qū)動開發(fā)；其次設(shè)計了實驗平臺對智能PAC系統(tǒng)進行仿真調(diào)試和現(xiàn)場實驗。論文最后展望了我國設(shè)施農(nóng)業(yè)溫室環(huán)境監(jiān)控的發(fā)展。 現(xiàn)場實驗表明，該智能PAC系統(tǒng)解決了日光溫室環(huán)境和生物信息數(shù)據(jù)采集、傳輸、備份問題，并且具有可定制化、可編程、運行穩(wěn)定可靠的特點，達到了預期的設(shè)計要求。
標簽： ARM 設(shè)施農(nóng)業(yè) 網(wǎng)絡(luò) 可編程
上傳時間： 2013-04-24
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在數(shù)字化推進速度加快的大背景下，全球農(nóng)業(yè)也由傳統(tǒng)農(nóng)業(yè)向現(xiàn)代農(nóng)業(yè)方向轉(zhuǎn)變，而實現(xiàn)農(nóng)業(yè)信息與數(shù)字化則是現(xiàn)代化農(nóng)業(yè)的重要標志與核心技術(shù)。我國農(nóng)業(yè)具有地域分散、對象多樣、生物自身變異大、環(huán)境因子不確定等特點，也是受環(huán)境影響最明顯的領(lǐng)域，因此對環(huán)境與生物信息的監(jiān)測顯得十分重要。同時現(xiàn)代無線網(wǎng)絡(luò)信息技術(shù)和計算機應(yīng)用等技術(shù)近幾年得到了長足的發(fā)展，廣泛的應(yīng)用于工業(yè)的各個領(lǐng)域。因此，將這些最新的技術(shù)應(yīng)用于相對發(fā)展較慢的農(nóng)業(yè)各領(lǐng)域顯得迫在眉睫。 本文根據(jù)農(nóng)業(yè)對象具有偏遠、分散、易變、多樣等特點，提出了一種針對農(nóng)業(yè)環(huán)境信息遠程監(jiān)測的系統(tǒng)設(shè)計方案，并從軟件和硬件二方面詳細介紹了系統(tǒng)方案的設(shè)計和實現(xiàn)方法。本研究通過采用μC/OS-Ⅱ系統(tǒng)的嵌入式技術(shù)，實現(xiàn)了數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)底層網(wǎng)絡(luò)與信息發(fā)布上層網(wǎng)絡(luò)的無縫連接為建立基于WEB的農(nóng)業(yè)環(huán)境遠程監(jiān)測系統(tǒng)奠定了基礎(chǔ)，同時也為農(nóng)業(yè)網(wǎng)絡(luò)通信“最后一公里”問題的解決提供了一種解決方案。 該系統(tǒng)的設(shè)計充分利用了網(wǎng)絡(luò)技術(shù)。通過INTERNET，用戶可以隨時了解農(nóng)業(yè)環(huán)境的實時情況以采取措施。系統(tǒng)中嵌入式操作系統(tǒng)μC/OS-Ⅱ的應(yīng)用提高了系統(tǒng)的實時性、可靠性和可擴展性：減少了對系統(tǒng)硬件的依賴，增加了系統(tǒng)安全性；降低了成本。特別是自主開發(fā)的核心板卡，經(jīng)連續(xù)的調(diào)試運行穩(wěn)定、數(shù)據(jù)可靠。 本文首先介紹了高速實時數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)的發(fā)展和現(xiàn)狀。由于傳統(tǒng)的設(shè)計方式的欠缺而考慮到將嵌入式操作系統(tǒng)引入到該系統(tǒng)中，很好的解決了多傳感器的接入，使得本系統(tǒng)具有巨大的靈活性和可擴展性。 本文以源碼開放的嵌入式操作系統(tǒng)μC/OS-Ⅱ為核心，以LPC2210微控制器為載體，充分利用GPRS無線網(wǎng)絡(luò)傳輸技術(shù)，實現(xiàn)了高速實時信息監(jiān)測系統(tǒng)的關(guān)鍵設(shè)計。 考慮到該系統(tǒng)以后的可擴展性，在設(shè)計的過程中硬件部分預留了一部分接口電路以備后續(xù)開發(fā)使用；軟件的設(shè)計過程中應(yīng)該注意的問題和實際操作中出現(xiàn)的一系列問題以及解決辦法在文中都有詳細的說明，并且軟件的基本構(gòu)架在文章中也有所體現(xiàn)，文章結(jié)尾給出了一些系統(tǒng)經(jīng)實驗后在WEB上發(fā)布顯示的數(shù)據(jù)。
標簽： ARM 嵌入式 無線遠程 環(huán)境監(jiān)測系統(tǒng)
上傳時間： 2013-05-17
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隨著人類基因組計劃的實施，通過基因組測序，蛋白質(zhì)序列測定結(jié)構(gòu)解析等實驗，分子生物學家提供了大量的有關(guān)生物分子的原始數(shù)據(jù)，需要利用現(xiàn)代計算技術(shù)對這些原始數(shù)據(jù)進行收集、整理、管理以便于檢索使用。而為了解釋和理解這些數(shù)據(jù)，還需要對數(shù)據(jù)進行比對、分析，建立計算模型，進行仿真、預測與驗證，因而出現(xiàn)生物信息學，它的出現(xiàn)，極大的促進了分子生物學的發(fā)展。
標簽： 基因組
上傳時間： 2015-03-11
上傳用戶：894898248
這是一些經(jīng)典算法的描述，是由中國科學院的張法院士所編寫的，對生物信息學有非常重要的意義。
標簽： 算法
上傳時間： 2014-12-02
上傳用戶：athjac
矩形編碼壓縮源代碼是針對圖象壓縮設(shè)計的程序，該算法可用于生物信息學，圖象處理等方面
上傳時間： 2015-04-13
上傳用戶：xz85592677
這是我在別人的工作基礎(chǔ)上編寫的生命游戲(life game)演示程序，可以比較不同初始條件或繁衍條件產(chǎn)生的不同演化結(jié)果。 生命游戲是細胞自動機的一種，以模擬生命的某種繁衍過程。根據(jù)不同的生命繁衍條件，可以衍生出豐富多彩的群體動力學。該游戲曾經(jīng)繁盛過一時，至今仍有很多愛好者。該模型在很多領(lǐng)域（如生物、物理等）都有實際的應(yīng)用。 在這個生命游戲中，繁衍條件比較簡單。有兩個60x60的方框區(qū)域，開始時每一個格子里都生活著一個生命個體（用1表示）。然后這些個體按照下面的條件繁衍：首先計算每一個格子周圍相鄰生存者的個數(shù)；如果有3個相鄰生存者，下一步這個格子將會有生存者（用黑色表示）；如果有2個(右邊方框的是1個)，這個格子下一步的狀態(tài)與上一步狀態(tài)相同；其余的情況下，下一步這個格子將沒有生存者（白色）。每一步計算所有的格子，共重復300步（開始6步按任意鍵執(zhí)行，以觀察開始的演化，后面的自動執(zhí)行）。 該程序用Turbo C++ 3.0編譯。這個游戲在《生物信息學》課上作為離散數(shù)學模型的演示程序。
上傳時間： 2013-11-30
上傳用戶：sammi
EM算法的改進，在此基礎(chǔ)上生物信息學的常用工具
標簽： 法的改進
上傳時間： 2013-12-25
上傳用戶：bcjtao
統(tǒng)計學習基礎(chǔ):數(shù)據(jù)挖掘、推理與預測介紹了這些領(lǐng)域的一些重要概念。盡管應(yīng)用的是統(tǒng)計學方法，但強調(diào)的是概念，而不是數(shù)學。許多例子附以彩圖。《統(tǒng)計學習基礎(chǔ):數(shù)據(jù)挖掘、推理與預測》內(nèi)容廣泛，從有指導的學習（預測）到無指導的學習，應(yīng)有盡有。包括神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、支持向量機、分類樹和提升等主題，是同類書籍中介紹得最全面的。計算和信息技術(shù)的飛速發(fā)展帶來了醫(yī)學、生物學、財經(jīng)和營銷等諸多領(lǐng)域的海量數(shù)據(jù)。理解這些數(shù)據(jù)是一種挑戰(zhàn)，這導致了統(tǒng)計學領(lǐng)域新工具的發(fā)展，并延伸到諸如數(shù)據(jù)挖掘、機器學習和生物信息學等新領(lǐng)域。許多工具都具有共同的基礎(chǔ)，但常常用不同的術(shù)語來表達。【內(nèi)容推薦】《統(tǒng)計學習基礎(chǔ):數(shù)據(jù)挖掘、推理與預測》試圖將學習領(lǐng)域中許多重要的新思想?yún)R集在一起，并且在統(tǒng)計學的框架下解釋它們。隨著計算機和信息時代的到來，統(tǒng)計問題的規(guī)模和復雜性都有了急劇增加。數(shù)據(jù)存儲、組織和檢索領(lǐng)域的挑戰(zhàn)導致一個新領(lǐng)域“數(shù)據(jù)挖掘”的產(chǎn)生。數(shù)據(jù)挖掘是一個多學科交叉領(lǐng)域，涉及數(shù)據(jù)庫技術(shù)、機器學習、統(tǒng)計學、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、模式識別、知識庫、信息提取、高性能計算等諸多領(lǐng)域，并在工業(yè)、商務(wù)、財經(jīng)、通信、醫(yī)療衛(wèi)生、生物工程、科學等眾多行業(yè)得到了廣泛的應(yīng)用。【作者簡介】Trevor Hastie,Robert Tibshirani和Jerome Friedman都是斯坦福大學統(tǒng)計學教授，并在這個領(lǐng)域做出了杰出的貢獻。Hastie和Tibshirani提出了廣義和加法模型，并出版專著“Generalized Additive Models”。Hastie的主要研究領(lǐng)域為：非參數(shù)回歸和分類、統(tǒng)計計算以及生物信息學、醫(yī)學和工業(yè)的特殊數(shù)據(jù)挖掘問題。他提出主曲線和主曲面的概念，并用S-PLUS編寫了大量統(tǒng)計建模軟件。Tibshirani的主要研究領(lǐng)域為：應(yīng)用統(tǒng)計學、生物統(tǒng)計學和機器學習。他提出了套索的概念，還是“An Introduction to the Bootstrap”一書的作者之一。Friedman是CART、MARS和投影尋蹤等數(shù)據(jù)挖掘工具的發(fā)明人之一。他不僅是位統(tǒng)計學家，而且是物理學家和計算機科學家，先后在物理學、計算機科學和統(tǒng)計學的一流雜志上表發(fā)論文80余篇。
標簽： 統(tǒng)計
上傳時間： 2022-05-04
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